טרם הקמת המדינה שכן בית האריזה במבנה הנטוש הסמוך כיום לקניון דרורים ותחנת האוטובוס על כביש 4. לאחר מכן הוקם בתוך פרדסי הישוב, כחלק מארבעה בתי אריזה נוספים, כך שהפרי לא יאלץ לעבור דרך ארוכה. המבנה שימש גם כמסתור נשק כנגד הבריטים.

כחברה רשמית הוקם בית האריזה בשנות ה-50, אולם במתכונתו הנוכחית הוא קיים משנת 1993. עד אז שיווקה המדינה את הפרי דרך שוהם. עם התפרקות המועצה יצאו לדרך עצמאית, ובית האריזה החל להתפתח.

קובי רייך, המנהל את בית האריזה כשלושים שנה, סיפר לעלון "עת ההדר" (מרץ 2023) כיצד הגיע לתפקיד: "עבדתי באבוקדו כמה שנים, מ-82' עד שנת 90'. כשהייתה המפלה הגדולה בענף החקלאות בשנות ה-80 המאוחרות, איחדו את הפרדס והאבוקדו ביחד וביקשו ממני לנהל את הענף." את בני לדרמן, מנהל השיווק של בית האריזה, משך קובי מהמשתלה באותם ימי משבר: "כשהיה המשבר משכתי אותו לפה שיהיה לי שותף בעבודה ולהביא חבר'ה צעירים, ומאז המשכנו ביחד לפתח את העסק הזה."

בהתחלה התמקד בית האריזה בשוק המקומי, בעיקר בהדרים. עם השנים הורחבה הפעילות גם לייצוא – תחילה בשל הצטמצמות התחרות בשוק המקומי, ולאחר מכן מתוך רצון להביא יותר פרי. כיום "פירות בני-דרור" הוא אחד מבתי האריזה הגדולים בארץ להדרים.